Karyotyping är processen att beställa och para ihop alla kromosomer som finns i en organism för att få en heltäckande syn på hela kromosomernas karta av en individ.
Men låt oss först se till att vi förstår vilka kromosomer som är i första hand. Kromosomer är strukturer som liknar tråden som finns i kärnan i varje kropps celler.
Varje kromosomstruktur innehåller hela din genetiska informationsplan för din kropp. Detta dikterar hur din kropp är strukturerad, reagerar på stimuli, predisponering mot sjukdomar, etc. Kvinnor har 2 'X' kromosomer, och män har en 'X' och en 'Y'-kromosom. Varje cell i din kropp innehåller 23 par kromosomer, totalt 46 kromosomer.
För att forskare ska kunna förstå kromosomernas sekvenser för varje patient använder de karyotypprogramvara . Denna typ av programvara är utformad för att utföra kromosomanalys, och det utvärderar strukturen och antalet en persons kromosomer. Genom att göra detta kan forskare och forskare upptäcka avvikelser.
I den här artikeln kommer vi att undersöka några bra programalternativ som gör att du kan utföra karyotypanalys.
- 1
ArgusSoft
ArgusSoft är ett bra programalternativ som gör att du automatiskt kan karyotypa mänskliga kromosomer genom bandposition och kan även användas för karyotypning av djur och växts kromosomer online.
Nyckelfunktioner:
- G, Q, R-färgning
- Automatiserad karyotypning av mänskliga kromosomer med erkännande av böjningar
- Automatiserad karyotypning av svinkromosomer
- 3 inbyggda baser av standard ideogram av mänskliga kromosomer med olika clearensnivåer - 400, 550 och 850 nivåer
- Kan lägga till baser av standardkromosomideogram för andra djur- och växtarter
- Provberedningsmetoder
- Inmatning av metafasplatta bilder med hjälp av en kamera och en scanner
- Medföljande bild med grafik
- Automatiserad fördelning av applicerade och kontaktande kromosomer
- Jämförelse av kromosomer och ideogram
Du kan också använda ArgusSoft för att träna systemet med kromosomerigenkänning med hjälp av förberedda preparat, överföra metafasplatta bilder och karyogram i inbyggd databas, producera mönster av rapporter, korrekta karyogram och lagra och skriva ut bilder och analysresultat.
Du kan få utbildning och stöd för att använda ArgusSoft från deras officiella hemsida. Supportcentret omfattar utbildning, underhåll och konsulttjänster.
Prova ArgusSoft
- 2
HiBand av Applied Spectral Imaging
HiBand är en mjukvara skapad av Applied Spectral Imaging, som kan utföra avancerad kromosomanalys genom att använda digitala karyotypfunktioner. Denna programvara
använder automatiska avsökningsfunktioner för en djup analys av kromosomstrukturen.
Du kan använda det breda utbudet av funktioner som finns i HiBand för indexering, räkning, lagring och hantering av resultatdata. Du kan också använda denna kraftfulla programvara för att automatiskt skanna kromosomsekvensen.
Resultaten som erhållits genom att använda karyotypfunktionerna, fann HiBand kan lagras på ett säkert ställe med lösenordsskyddade och krypterade lager. Detta ger dig lugn och ro när det gäller att förlora viktiga sekvenseringsdata, och på grund av detta förbättras även ditt laboratories effektivitet.
Sortering genom resultaten görs på ett mycket enkelt sätt, du behöver bara söka efter den specifika sekvensen av kromosomer, och alla resultat visas på en inbyggd skärm som ger enkel åtkomst att ändra, granska och lägga till taggar i alla av filerna.
Nyckelfunktioner:
- Brightfield Karyotyping-G-Band och R-Band
- Fluorescens Karyotyping-Q-Band, R-Band och FISH
- Spektral karyotypning
- Automatisk kromosomräkning
- Kromosom indexering och klassificering
- Avancerad separation av kromosomer och avancerad bildförbättring
- Bildgalleri - kan presentera alla fall metafaser och karyotyper på en skärm
- Kan jämföra kromosomer - se dem sida vid sida
- Abberant Ideogram - du kan lägga till kromosomer, celler, ideogram och annoteringar i en bildgenerator
HiBand använder helautomatiska arbetsflöden för ökad lab effektivitet, har start-och-promenad-skanning funktioner, hittar metafaser, läser automatiskt streckkoder, laddar upp bilder i realtid under bildskanning och exporterar även till lab LIS Central Portal och Databas.
Prova HiBand
- 3
Ikaros av MetaSystems
Detta karyotypsystem har ett mycket intuitivt användargränssnitt som erbjuder alla funktioner på en skärm. Detta möjliggör enkel och snabb åtkomst till all information som erhållits.
Ikaros kan användas med Neon, vilket är en plattform som är utformad för att hjälpa till med bilddata och fallorganisation. Neon samlar in data från alla bildhanteringsjobb, externa källor och låter dig presentera dem på ett lättförståeligt sätt med hjälp av en hanteringspanel.
Med det här verktyget kan du alltid ha viktig information nära till hands och lagras på ett säkert sätt, men använder mycket starka datahanteringsalgoritmer, har ett bra utbud av sätt att observera data och kan ge specifika sökningar baserade på nyckelord och dataegenskaper.
Kolla in mer information om Neon och dess funktioner här .
Ikaros stöder många olika bandtekniker - Brightfield G-Band och R-Band, Fluorescens Q-Band, R-Band och FISH -, erbjuder ett stort antal pre-definierar karyogramformer för människor, växter och djur. Du kan enkelt redigera dessa formulär för att lägga till data som krävs för den typ av forskning du gör.
Att du kan jämföra kromosomer med klass eller karyogram, ger dig mycket användbar information som gör att du enkelt kan identifiera skillnader.
Försök med Ikaros
- 4
MetaClass av Microptic
MetaClass är en bra karyotyoprogramvara som är designad på ett modulärt sätt. Denna programvara hjälper dig att utföra karyotyp- och FISH-studier av kromosomer.
MetaClass bildas av följande moduler:
- MetaClass Database
Databas som kan installeras med någon av MetaClass-modulerna. Gör att du kan lagra patientuppgifter och ger dig enkel tillgång till resultat. Du kan skapa anpassade rapporter på vilket språk som helst med den här modulen.
- MetaClass Karyotyping
Gör det möjligt att studera en karyotyp efter att bilderna i metafasförberedelsesteget har tagits digitalt och ordna dem i par baserat på storlek, position etc. Denna modul ger dig höga kvalitetsresultat när det gäller kromosomband, och det kan också ge dig professionella rapporter.
Viktiga funktioner inkluderar:
- Studien av karyotyp analyseras under brightfield 100X förstoring
- Kan fånga flera metafasbilder
- Bildkvaliteten kan ändras för skarpare resultat
- Automatisk klassificering av kromosomer
- 4 skärmvyer - Metafas, Karyotyp och Oklassificerat kromosomfönster
- Kan visa kromosom prototyper
- Kromosomer som inte klassificeras kan automatiskt eller manuellt korrigeras - överlagringar, separation, korsningar, rotationer etc.
- MTC-sessionfiler eller BMP-bilder kan sparas och laddas om när som helst
- Kan exportera enskilda kromosomer till Metaclass Database med möjlighet att lägga till kommentarer och anteckningar
Här är ett exempel på en Metaclass-karyotypningsrapport.
- MetaClass FISH
Detta är en analysmodul som låter dig få Fluorescent IN SITU Hybridization (FISH) bild. Denna modul tar bilder med hjälp av fluorescerande DNA-prober och låter dig bekräfta genetiska abnormiteter - trisomier, mocrodelektioner, kromosomomläggningar, etc.
FISH-bilder analyseras under 100X förstoring och, för ett bredare spektrum av bildskärpa, kan också fånga bilder med olika filter.
Om du är intresserad av att få veta mer om modulerna som presenteras ovan, och andra funktioner, kan du titta igenom MetaClass-katalogen.
Om du är en nyfiken typ och vill se en rapport som erhållits genom att använda FISH-metoden, kan du
en PDF-fil.Prova MetaClass
- 5
GenASis Bandview
GenASis Bandview är en annan stor karyotypprogramvara som är byggd av moduler med olika capabitilites. Du kan använda den här appen för att utföra karyotypdiagnos och få noggranna testresultat.
Med den här programvaran kan du fullt ut anpassa arbetsflödet och diagnosprocessen, beroende på företagets behov och de mål du försöker uppnå.
Det breda utbudet av verktyg som tillhandahålls i BandView är lättillgängligt med bara ett klick på musen och erbjuder kraftfull K / K / Q / Band-karyotypingupplevelse. Du kan välja mellan ett automatiskt eller manuellt arbetsflöde när det gäller att lokalisera metafaser och ta bilder.
Kromosomavvikelser, om de hittas, kan observeras genom tillsats, radering eller omplacering av patientens genetiska material. Med BandView kan du använda band av FISH molekylteknik.
FISH använder flourescent prober för att fästa till olika delar av kromosomen, vilket gör att mjukvaran kan detektera och lokalisera de abnormalititer som finns i specifika DNA-sekvenser.
Prova GenASis Bandview
Slutsats
I den här artikeln undersökte vi några av de bästa automatiserade karyotypprogramvaran som finns på marknaden i slutet av 2018.
Kariotypprogramvarualternativen som beskrivs i denna artikel erbjuder dig en mängd olika funktioner som hjälper dig att nå ditt företags mål.
Genom att använda denna typ av programvara kan du räkna tusentals kromosomstrukturer snabbt, analysera med olika professionella tekniker och producera högkvalitativa rapporter som gör att du enkelt kan identifiera eventuella abnormiteter.
Vi skulle älska att ta reda på vad din åsikt är med avseende på programvaran vi presenterade i denna topp 5-lista. Glöm inte att meddela oss genom att använda kommentarsektionen nedan.
RELATERADE GUIDER DU KONTROLLERAR:
- Behöver du undersökningsprogram för akademisk forskning? Här är 5 verktyg
- 5 bästa programvara för akademiskt skrivande
- 10 bästa plagiatprogramvaran för att upptäcka kopieringsinnehållet år 2019
